無(wú)菌室是企業(yè)存放無(wú)菌產(chǎn)品或道具的地方，不同行業(yè)有不同的使用方法，不同位置存放不同的器材或道具。如醫院的儀器、器械、平皿、紗布、手術(shù)器具等與傷口接觸的任何東西都是存放在無(wú)菌室。無(wú)菌室應保持清潔，備有工作濃度的消毒液，70%的酒精，0.1%的新潔爾滅溶液等，而且嚴禁堆放雜物，以防污染。
無(wú)菌室空氣凈化工程是屬于生物凈化工程的一種，一般無(wú)菌室要求的潔凈度為萬(wàn)級，標準的微生物檢測實(shí)驗室都會(huì )專(zhuān)門(mén)開(kāi)辟5~8個(gè)平方出來(lái)建造無(wú)菌室，可以用板材和玻璃建造，面積不宜過(guò)大，約4~5平方米即可，高2.5米左右。無(wú)菌室只要夠放置實(shí)驗室樣品及必需的設備即可，面積無(wú)需過(guò)大而造成浪費，面積過(guò)大對于做無(wú)菌室空氣凈化工程來(lái)說(shuō)不僅僅是提高建造成本而已，日后的運行及維護費用也會(huì )高的令人驚訝。
無(wú)菌室外要設一個(gè)緩沖間，緩沖間的門(mén)和無(wú)菌室的門(mén)不要朝向同一方向，以免氣流帶進(jìn)雜菌。無(wú)菌室和緩沖間都必須密閉。室內裝備的換氣設備必須有空氣過(guò)濾裝置。一般微生物檢測按照實(shí)驗室行業(yè)要求都需要在無(wú)菌室中進(jìn)行，很多食品菌、微生物等都是在超凈工作臺中完成檢測和化驗的。
隨著(zhù)科技的進(jìn)步，社會(huì )對飲食，健康等問(wèn)題看得十分重視，無(wú)菌室的要求也越來(lái)越嚴格。國家為了保障人民的安全問(wèn)題，無(wú)菌室在不斷的普及。因此無(wú)菌室空氣凈化將在凈化工程領(lǐng)域扮演著(zhù)越來(lái)越重要的角色。