有實(shí)驗室的地方,就不可避免的會(huì )出現實(shí)驗室污染。實(shí)驗室的污染,不僅會(huì )影響實(shí)驗與科研的質(zhì)量和效果,還對實(shí)驗室工作人員的身體健康有損害,今天小編就和您一起了解下PCR實(shí)驗室的污染原因及解決方法。
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標本間交叉污染:標本污染主要有收集標本的容器被污染,或標本放置時(shí),由于密封不嚴溢于容器外,或容器外粘有標本而造成相互間交叉污染;標本核酸模板在提取過(guò)程中,由于吸樣槍污染導致標本間污染;有些微生物標本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴散,導致彼此間的污染。
PCR試劑的污染:主要是由于在PCR試劑配制過(guò)程中,由于加樣槍、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。
PCR擴增產(chǎn)物污染:這是PCR反應中最主要最常見(jiàn)的污染問(wèn)題。因為PCR產(chǎn)物拷貝量大,遠遠高于PCR檢測數個(gè)拷貝的極限,所以極微量的PCR產(chǎn)物污染,就可造成假陽(yáng)就可形成假陽(yáng)性。
還有一種容易忽視,最可能造成PCR產(chǎn)物污染的形式是氣溶膠污染;在空氣與液體面摩擦時(shí)就可形成氣溶膠,在操作時(shí)比較劇烈地搖動(dòng)反應管,開(kāi)蓋時(shí)、吸樣時(shí)及污染進(jìn)樣槍的反復吸樣都可形成氣溶膠而污染。
實(shí)驗室中克隆質(zhì)粒的污染:在分子生物學(xué)實(shí)驗室及某些用克隆質(zhì)粒做陽(yáng)性對照的檢驗室,這個(gè)問(wèn)題也比較常見(jiàn),因為克隆質(zhì)粒在單位容積內含量相當高,另外在純化過(guò)程中需用較多的用具及試劑,而且在活細胞內的質(zhì)粒,由于活細胞的生長(cháng)繁殖的簡(jiǎn)便性及具有很強的生命力,其污染可能性也很大。
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一個(gè)好的實(shí)驗室,要時(shí)刻注意污染的監測,考慮有無(wú)污染是什么原因造成的污染,以便采取措施,防止和消除污染。
對照試驗
1、陽(yáng)性對照:在建立PCR反應實(shí)驗室及一般的檢驗單位都應設有PCR陽(yáng)性對照,它是PCR
2、陰性對照:每次PCR實(shí)驗務(wù)必做陰性對照。它包括①標本對照:被檢的標本是血清就用鑒定后的正常血清作對照;被檢的標本是組織細胞就用相應的組織細胞作對照。②試劑對照:在PCR試劑中不加模板DNA或RNA,進(jìn)行PCR擴增,以監測試劑是否污染。
3、重復性試驗
4、選擇不同區域的引物進(jìn)行PCR擴增
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進(jìn)行PCR操作時(shí),操作人員應該嚴格遵守一些操作規程,最大程度地降低可能出現的PCR污染或杜絕污染的出現。
劃分操作區:目前,普通PCR尚不能做到單人單管,實(shí)現完全閉管操作,但無(wú)論是否能夠達到單人單管,均要求實(shí)驗操作在三個(gè)不同的區域內進(jìn)行,PCR的前處理和后處理要在不同的隔離區內進(jìn)行:
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2.標本制備區。
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切記:任何一間的產(chǎn)物及器材不要拿到其他兩個(gè)工作區。
分裝試劑:PCR擴增所需要的試劑均應在生物安全柜、裝有紫外燈的超凈工作臺或負壓工作臺配制和分裝。所有的加樣器和吸頭需固定放于其中,不能用來(lái)吸取擴增后的DNA和其他來(lái)源的DNA:
1.PCR用水應為高壓的雙蒸水;
2.引物和dNTP用高壓的雙蒸水在無(wú)PCR擴增產(chǎn)物區配制;
3.引物和dNTP應分裝儲存,分裝時(shí)應標明時(shí)間,以備發(fā)生污染時(shí)查找原因。
實(shí)驗操作注意事項
盡管擴增序列的殘留污染大部分是假陽(yáng)性反應的原因,樣品間的交叉污染也是原因之一。因此,不僅要在進(jìn)行擴增反應是謹慎認真,在樣品的收集、抽提和擴增的所有環(huán)節都應該注意:
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